2025.12.26

Искусственный интеллект открыл 360 тысяч скрытых «выключателей» в ДНК

Международная группа исследователей, включая специалистов из Высшей школы экономики, представила первую полную карту квадруплексов — кратковременных структур в ДНК, регулирующих включение и выключение генов. Эти квадруплексы формируются из участков ДНК, богатых гуанином, и служат ориентирами для белков, контролирующих активность генов. Поскольку квадруплексы быстро появляются и исчезают, традиционные методы их картирования оказались недостаточными. Для решения этой проблемы ученые применили искусственный интеллект, обучив модель DNABERT с использованием базы данных EndoQuad, содержащей экспериментально подтвержденные квадруплексы. Модель GQ-DNABERT предсказала около 360 тысяч квадруплексов, что значительно превышает результаты экспериментальных методов. Важно отметить, что квадруплексы работают парами, формируясь в промоторах и энхансерах, которые совместно регулируют экспрессию генов. Анализ показал, что в здоровых тканях пары квадруплексов связаны с конкретными функциями, тогда как в опухолевых клетках они активируют универсальные программы роста. Это открытие может помочь в разработке новых методов противоопухолевой терапии.